Pangunahing Pagkakaiba - cDNA vs Genomic DNA

Ang Komplementaryong DNA (cDNA) at genomic DNA ay dalawang uri ng mga molekulang DNA na ginamit sa mga eksperimento sa pananaliksik sa molekular biology. Parehong cDNA at genomic DNA ay binubuo ng DNA nucleotides. Ang cDNA ay ginawa ng reverse transcription ng nakuha na RNA mula sa tisyu. Ang mga uri ng RNA na ginamit para sa reverse transcription ay maaaring kabuuang RNA, pre-mRNA, RNA, ribosomal RNA, o tRNA. Gayunpaman, ang genomic DNA ay maaaring direktang ihiwalay mula sa cell. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng cDNA at genomic DNA ay iyon Ang cDNA ay kumakatawan sa transcriptome ng isang partikular na organismo samantalang ang genomic DNA ay kumakatawan sa genome.

Saklaw ng Mga Susing Lugar

1. Ano ang cDNA - Kahulugan, Katotohanan, Tungkulin 2. Ano ang Genomic DNA - Kahulugan, Katotohanan, Tungkulin 3. Ano ang Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng cDNA at Genomic DNA - Balangkas ng Mga Karaniwang Tampok 4. Ano ang Pagkakaiba sa Pagitan ng cDNA at Genomic DNA - Paghahambing ng Mga Pangunahing Pagkakaiba

Pangunahing Mga Tuntunin: Komplementaryong DNA (cDNA), Genome, Genomic DNA (gDNA), Reverse Transcription, RNA, Transcriptome

Ano ang cDNA

cDNA (pantulong na DNA) ay tumutukoy sa gawa ng tao na DNA na ang mga pangunahing pagkakasunud-sunod ay komplementaryo sa DNA. Ito ay ginawa mula sa reverse transcription ng mga template ng RNA. Ang kabuuang RNA, pre-mRNA, RNA, ribosomal RNA o tRNA ay maaaring magamit para sa reverse transcription. Ang Reverse transcriptase ay ang enzyme na nagpapasara sa reaksyon ng paggawa ng cDNA mula sa RNA. Ang reverse transcription na isinama sa PCR ay ipinapakita sa figure 1.

Larawan 1: Reverse Transcription Kaakibat ng PCR

Pangunahing ginagamit ang cDNA sa pag-clone ng mga eukaryotic genes sa prokaryotic genome. Ang mga exon ay binubuo ng rehiyon ng pag-cod ng mga protina. Sa mga eukaryote, ang rehiyon ng coding ay nagambala ng mga intron. Sa panahon ng transcription, ang parehong mga intron at exon ay naka-code sa pre-mRNA. Ngunit sa panahon ng pagpoproseso ng mRNA, ang mga intron ay aalisin mula sa mRNA, na gumagawa ng isang matandang mRNA sa pamamagitan ng paghahati ng magkasama ng mga exon. Ang kabuuang mRNA ng isang organismo ay tinatawag na transcriptome. Gayunpaman, ang mga prokaryote ay kulang sa mga mekanismo ng pagpoproseso ng mRNA. Samakatuwid, ang mRNA ay ginagamit upang synthesize cDNA na naglalaman lamang ng mga rehiyon ng pag-coding ng protina ng genome. Ang cDNA na ito ay ginagamit upang i-clone ang mga gen sa mga prokaryote. Ang cDNA ay likas na ginawa sa mga retrovirus habang ginawang DNA ang genome ng RNA.

Ano ang Genomic DNA

Genomic DNA (gDNA) ay tumutukoy sa kabuuang hanay ng chromosomal DNA sa genome. Ang kabuuang hanay ng mga gen ng isang partikular na organismo ay tinukoy bilang genome nito. Gayunpaman, hindi lamang ang mga gen ng genome ang aktibo. Karamihan sa mga pangkat ng mga organismo ay may magkatulad na uri ng genomic DNA sa loob ng pangkat. Ang genome ng organismo ay ipinapasa mula sa susunod na henerasyon hanggang sa isa pa. Pangkalahatan, ang mga genome ay binubuo ng isang malaking bilang ng mga pares ng base. Bilang isang halimbawa, ang genome ng tao ay binubuo ng humigit-kumulang na 3 bilyong mga pares ng base. Ang mga chromosome ng genome ng tao ay ipinapakita sa pigura 2.

Larawan 2: Mga Chromosome ng Human Genome

Ang apat na uri ng pagkakasunud-sunod na matatagpuan sa genomic DNA ay mga gen na naka-code sa protina, magkatulad na paulit-ulit na mga gen, paulit-ulit na DNA, at spacer DNA. Ginamit ang Genomic DNA sa maraming mga eksperimento sa molekular biology. Ang paghihiwalay ng genomic DNA ay madali kung ihahambing sa paghahanda ng cDNA. Maaaring magamit ang Genomic DNA bilang mga template ng PCR, sa pag-clone, pagkakasunud-sunod, paghahanda ng mga genomic library, DNA fingerprinting, pag-aaral ng mga istruktura ng gen, at pagtuklas ng mga mutasyon / abnormalidad.

Mga pagkakatulad sa pagitan ng cDNA at Genomic DNA

Pagkakaiba sa pagitan ng cDNA at Genomic DNA

Kahulugan

cDNA: Ang cDNA ay ang synthetic DNA na ang mga pangunahing pagkakasunud-sunod ay komplementaryo sa Genomic DNA.

Genomic DNA: Ang Genomic DNA ay ang kabuuang hanay ng chromosomal DNA sa genome.

Kinatawan

cDNA: Ang cDNA ay kumakatawan sa transcriptome.

Genomic DNA: Kinakatawan ng DNA ang genome.

Naka-synthesize / Kinuha mula sa

cDNA: Ang cDNA ay na-synthesize mula sa reverse transcription ng iba't ibang uri ng RNA.

Genomic DNA: Ang Genomic DNA ay maaaring makuha mula sa mga mayroon nang genome.

Nilalaman

cDNA: Ang cDNA ay binubuo ng mga exon o coding na rehiyon.

Genomic DNA: Ang Genomic DNA ay binubuo ng mga pagkakasunud-sunod ng coding at non-coding ng isang organismo.

Dami

cDNA: Naglalaman ang cDNA ng ilang mga pares ng batayan.

Genomic DNA: Naglalaman ang Genomic DNA ng isang malaking bilang ng mga pares ng base.

Gamitin

cDNA: Ginagamit ang cDNA upang makabuo ng mga library ng cDNA.

Genomic DNA: Maaaring magamit ang Genomic DNA upang makabuo ng mga genomic library.

Konklusyon

Ang cDNA at genomic DNA ay dalawang uri ng mga molekulang DNA na ginamit sa iba't ibang uri ng mga eksperimento sa molekular biology. Ang cDNA ay na-synthesize mula sa RNA, at binubuo lamang ito ng mga exons. Samakatuwid, ito ay kumakatawan sa transcriptome ng isang organismo. Ang genomic DNA ay madaling makuha mula sa nucleus ng cell. Binubuo ito ng parehong mga rehiyon ng pag-cod at hindi pag-coding. Kinakatawan nito ang genome ng isang partikular na organismo. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng cDNA at genomic DNA ay ang uri ng DNA na naroroon sa bawat uri ng mga molekulang DNA.

Sanggunian:

1. "CDNA (Komplementaryong DNA)." Mga Human Gen, Magagamit dito.2. "GDNA - Genomic DNA | Advanced Analytical (AATI). ” Advanced Analytical Technologies, Inc. (AATI), Magagamit dito.3. "Paghiwalay at Mga Application ng Genomic DNA." Scribd, Magagamit dito.

Kagandahang-loob ng Larawan:

1. "Reverse transcription polymerase chain reaction" Ni Jpark623 - Sariling gawain (CC BY-SA 3.0) sa pamamagitan ng Wikimedia Wikimedia2. "Human genome to genes" (CC BY 2.0) sa pamamagitan ng Commons Wikimedia