Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng kolonya at hybridization ng plaka ay ang ang colony hybridization ay ang pamamaraang ginamit sa pagpili ng mga kolonya ng bakterya na may mga nais na gen habang ang hybridization ng plaka ay ang pamamaraan ng pagpili ng mga phage na may nais na mga gen. Bukod dito, ang colony hybridization ay maaaring magamit sa pag-screen ng mga plasmid– o cosmid-based na mga aklatan habang ang hybridization ng plaka ay maaaring magamit sa pag-screen ng mga library ng phage.

Ang kolonya at hybridization ng plaka ay dalawang pamamaraan na ginamit sa pag-screen ng mga genomic o cDNA library. Tinawag din sila pag-angat ng kolonya at pag-angat ng plaka ayon sa pagkakabanggit.

Colony, Colony Hybridization, Library Screening, Plaque, Plaque Hybridization

Ano ang Colony Hybridization

Ang colony hybridization ay isang pamamaraan ng pag-screen na ginamit sa pagpili ng mga kolonya ng bakterya na may nais na pagkakasunud-sunod ng DNA. Tinawag din yan colony blot hybridization, pag-angat ng kolonya o replica na kalupkop. Pinapayagan ang pag-screen ng mga kolonya na pinahiran ng mataas na density. Ang orihinal na pamamaraan ng colony hybridization ay unang binuo ni Grunstein at Hogness. Una, ang mga kolonya ng bakterya ay maaaring mabago sa isang lamad at ang mga kolonya ng bakterya ay lysed, na inilalantad ang mga nucleic acid. Pagkatapos, ang nakalantad na mga nucleic acid ay naayos sa lamad sa pamamagitan ng denaturing ang mga ito at hybridized sa mga radioactive probe.

Larawan 1: Pamamaraan ng Colony Hybridization

Ang isang kolonya ay isang kumpol ng bakterya na nabuo mula sa isang solong bacterial cell sa pamamagitan ng asexual reproduction. Samakatuwid, ang lahat ng mga cell ng bakterya sa isang partikular na kolonya ay nagtataglay ng parehong genetic makeup pati na rin ang nabago na materyal na genetiko. Pangkalahatan, ang bakterya ay nabago sa tulong ng mga plasmid o cosmid vector.

Ano ang Plaque Hybridization

Ang plaka hybridization ay ang pamamaraan ng pag-screen para sa recombinant phages. Ito ay isang pagbabago ng colony hybridization nina Benton at Devis noong 1977. Ang pamamaraan ay tinawag din pag-angat ng plaka. Ang pamamaraan ng hybridization ng plaka ay katulad ng pamamaraan ng colony hybridization at ang mga plake ay naangat sa pamamagitan ng pakikipag-ugnay sa kanila sa isang nitrocellulose membrane. Ang mga nucleic acid ay inilantad at naayos sa lamad, hybridizing na nais ng mga probe.

Larawan 2: Mga Plaka sa isang Agar Plate

Ang isang plaka ay isang malinaw na zone sa isang agar plate na ginawa ng isang partikular na bacteriophage ng lysis ng mga bacterial cell sa lugar na iyon. Dahil sa mas kaunting dami ng DNA na inilipat sa nitrocellulose membrane, ang hybridization ng plaka ay gumagawa ng mas kaunting mga signal sa background.

Mga pagkakatulad sa pagitan ng Colony at Plaque Hybridization

Pagkakaiba sa pagitan ng Colony at Plaque Hybridization

Kahulugan

Ang colony hybridization ay tumutukoy sa isang paraan ng pagpili ng mga kolonya ng bakterya na may nais na mga gene habang ang hybridization ng plaka ay tumutukoy sa isang pamamaraan sa pag-screen na ginamit sa pagkilala sa mga recombinant phage.

Binuo ni

Ang colony hybridization ay unang binuo ni Grunstein at Hogness habang ang plaque hybridization ay unang binuo nina Benton at Devis noong 1977.

Mga Uri ng Aklatan

Ang colony hybridization ay nagsasangkot ng pagkilala sa mga aklatan na batay sa plasmid- o kosmid habang ang hybridization ng plaka ay nagsasangkot ng pagkilala sa mga library ng phage.

Bilang ng Mga Lift

Ang mga kolonya ay maaaring iangat sa isang solong oras habang ang mga plake ay maaaring maiangat ng maraming beses.

Mga Signal sa Background

Konklusyon

Ang colony hybridization ay isang pamamaraan ng pag-screen ng mga kolonya ng bakterya sa mga silid aklatan na ginawa gamit ang mga plasmid o cosmid vector. Sa kabilang banda, ang hybridization ng plaka ay isang pamamaraan sa pag-screen ng mga bacteriophage sa mga aklatan ng phage. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng kolonya at hybridization ng plaka ay ang uri ng mga aklatan na na-screen sa bawat pamamaraan.

Sanggunian:

1. Kaksonen, Anna. "Mga Molecular Approach para sa Pagsusuri ng Microbial Community." Leaching - BioMineWiki, 20 Abril 2006, Magagamit dito2. Dale, J W, at P J Greenaway. "Pagkilala sa Mga Recombinant Phage ng Plaque Hybridization." Mga pamamaraan sa Molecular Biology (Clifton, N.J.)., U.S. National Library of Medicine, Magagamit Dito

Kagandahang-loob ng Larawan:

1. "Blot Hybridization" Ni Kaksonen - http://wiki.biomine.skelleftea.se/biomine/molecular/index_22.htm (Public Domain) sa pamamagitan ng Commons Wikimedia 2. "M. smegmatis plaka ”Ni Wazzzup7up - Sariling gawain (Public Domain) sa pamamagitan ng Wikimedia Wikimedia