Pangunahing Pagkakaiba - DNA Polymerase 1 vs 3

Ang DNA polymerase 1 at 3 ay dalawang uri ng DNA polymerases na kasangkot sa pagtitiklop ng prokaryotic DNA. Tinutulungan ng mga polymerase ng DNA ang pagbubuo ng isang bagong DNA strand sa pamamagitan ng pag-iipon ng mga nucleotide sa strand ng magulang. Ang parehong DNA polymerase 1 at 3 ay nagtataglay ng replicative na aktibidad sa direksyon na 5 'hanggang 3'. Nagtataglay ang DNA polymerase 1 ng parehong aktibidad na 5 'hanggang 3' at 3 'hanggang 5' exonuc please. Gayunpaman, ang DNA polymerase 3 ay nagtataglay lamang ng aktibidad na 3 'hanggang 5' na exonuc please. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng DNA polymerase 1 at 3 ay iyon Ang DNA polymerase 1 ay kasangkot sa pag-aalis ng mga primer mula sa mga fragment at pagpapalit ng puwang ng mga nauugnay na nucleotide samantalang ang DNA polymerase 3 ay pangunahin na kasangkot sa pagbubuo ng mga nangungunang at lagging strands.

Saklaw ng Mga Susing Lugar

1. Ano ang DNA Polymerase 1 - Kahulugan, Istraktura, Pag-andar 2. Ano ang DNA Polymerase 3 - Kahulugan, Istraktura, Pag-andar 3. Ano ang Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng DNA Polymerase 1 at 3 - Balangkas ng Mga Karaniwang Tampok 4. Ano ang Pagkakaiba sa Pagitan ng DNA Polymerase 1 at 3 - Paghahambing ng Mga Pangunahing Pagkakaiba

Pangunahing Mga Tuntunin: DNA Polymerase 1, DNA Polymerase 3, 3 'To 5' Exonuclease Aktibidad, 5 'To 3' Exonuclease Aktibidad, Gap Filling, Klenow Fragment, Polymerization, Proofreading, Prokaryotic DNA Replication

Ano ang DNA Polymerase 1

Ang DNA polymerase 1 ay isang uri ng DNA polymerases na nagtataglay ng aktibidad ng polimerisasyon, aktibidad sa pag-proofread, at aktibidad ng panimulang pagtanggal. Ang DNA polymerase 1 ay unang natuklasan ni Arthur Kornberg noong 1956. Ginawaran siya ng Nobel Prize para sa pagtuklas na ito noong 1959. Ang DNA polymerase 1 ay na-encode ng polA gene. Ang laki ng gen ng polA ay 3000 bp. Ang DNA polymerase 1 ay kasangkot sa prokaryotic DNA replication dahil tinutulungan nito ang pagbubuo ng isang bagong DNA strand sa direksyon na 5 'to 3'. Bukod dito, ang DNA polymerase 1 ay kasangkot sa pagpuno ng mga puwang, pagkumpuni, at muling pagsasama. Ang enzyme, DNA polymerase 1 ay pumupuno sa mga puwang sa dobleng-straced na DNA, na mahalaga sa pagkumpuni ng DNA. Nagtataglay ang DNA polymerase 1 ng parehong aktibidad na 3 'hanggang 5' exonuc please at ang aktibidad na 5 'hanggang 3' exonuc please. Ang aktibidad na 5 'hanggang 3' exonuc please ay nagpapasama sa parehong solong- at doble-straced na DNA sa direksyon na 5 'hanggang 3'. Kapag ang aktibidad na 5 'to 3' exonuc please ay tinanggal mula sa DNA polymerase 1 holoenzyme, ang natitirang molekula ay tinawag na Klenow na fragment.

Larawan 1: Mga functional na domain ng DNA polymerase 1

Ang fragment ng Klenow ay isang kapaki-pakinabang na molekula sa mga reaksyon ng amplification ng DNA. Ito ay mahalaga sa hindi maayos na pagkumpuni. Ang tatlong mga domain ng pagganap ng DNA polymerase 1 ay ipinakita sa pigura 1.

Ano ang DNA Polymerase 3

Ang DNA polymerase 3 ay ang pangunahing enzyme na kasangkot sa prokaryotic DNA replication. Nagtataglay ang DNA polymerase 3 ng 5 'hanggang 3' na aktibidad ng polimerisasyon kung saan ang mga bagong nucleotide ay idinagdag sa lumalaking kadena sa 3 'na dulo nito. Tinutulungan ng enzyme ang base na pagpapares ng mga papasok na nucleotide na may template ng strand. Ang iba pang pag-andar ng DNA polymerase 3 ay ang pag-proofread ng replicated DNA. Ang DNA polymerase 3 ay nagtataglay ng aktibidad na 3 'hanggang 5' exonuc please. Samakatuwid, binabasa ng enzyme na ito ang naidagdag na mga nucleotide, at kung mayroong anumang hindi pagtutugma sa strand ng template, aalisin ito at muling mai-synthesize. Samakatuwid, ang DNA polymerase 3 ay mahalaga sa pagpapanatili ng katatagan ng genome.

Larawan 2: DNA polymerase 3

Ang DNA polymerase 3 holoenzymes ay binubuo ng sampung mga subunit, na nakaayos sa dalawang DNA polymerases. Ang α subunit ay ang catalytic subunit. Ang ε subunit ay may aktibidad na 3 'hanggang 5' na pag-proofread. Ang unit subunit ay may isang hindi kilalang pagpapaandar. Ang α subunit ay naka-encode ng dnaE gene. Ang θ at θ mga subunit ay naka-encode ng mga dnaQ at holE na mga gene. Ang istraktura ng DNA polymerase 3 ay ipinapakita sa pigura 2.

Mga pagkakatulad sa pagitan ng DNA Polymerase 1 at 3

Pagkakaiba sa Pagitan ng DNA Polymerase 1 at 3

Kahulugan

DNA Polymerase 1: Ang DNA polymerase 1 ay isang DNA polymerase na naka-encode ng polA gene at kasangkot sa prokaryotic DNA replication.

DNA Polymerase 3: Ang DNA polymerase 3 ang pangunahing enzyme na tumutulong sa prokaryotic DNA replication.

Pagtuklas

DNA Polymerase 1: Ang DNA polymerase 1 ay unang natuklasan ni Arthur Kornberg noong 1956.

DNA Polymerase 3: Ang DNA polymerase 3 ay unang natuklasan nina Thomas Kornberg at Malcolm Gefer noong 1970.

Na-encode ni

DNA Polymerase 1: Ang DNA polymerase 1 ay naka-encode ng polyA gene.

DNA Polymerase 3: Ang DNA polymerase 3 ay naka-encode ng dnaE, dnaQ, at holE genes.

Pamilya

DNA Polymerase 1: Ang DNA polymerase 1 ay kabilang sa pamilya ng polymerase ng DNA na A.

DNA Polymerase 3: Ang DNA polymerase 3 ay kabilang sa pamilya ng polymerase ng DNA na C.

Gawain ng Exonuclease

DNA Polymerase 1: Ang DNA polymerase 1 ay may parehong aktibidad na 3 'hanggang 5' exonuc please at 5 'hanggang 3' exonuc please na aktibidad.

DNA Polymerase 3: Ang DNA polymerase 3 ay mayroon lamang aktibidad na 3 'hanggang 5' na exonuc please.

Pag-andar

DNA Polymerase 1: Inaalis ng DNA polymerase 1 ang RNA primer mula sa 5 'hanggang 3' na direksyon.

DNA Polymerase 3: Ang DNA polymerase 3 ay nagdaragdag ng mga deoxyribonucleic acid sa 3’na dulo.

RNA Primer

DNA Polymerase 1: Tinatanggal ng DNA polymerase 1 ang RNA primer.

DNA Polymerase 3: Ang DNA polymerase 3 ay nangangailangan ng isang RNA primer upang ma-synthesize ang DNA.

Sintesis ng DNA

DNA Polymerase 1: Ang DNA polymerase 1 ay nagdaragdag ng mga nucleotide sa lumalaking kadena ng polynucleotide.

DNA Polymerase 3: Ang DNA polymerase 3 ang susi na enzyme para sa pagbubuo ng DNA sa mga prokaryote.

Lagging / Leading Strands

DNA Polymerase 1: Gumagawa lamang ang DNA polymerase 1 sa lagging strand.

DNA Polymerase 3: Ang DNA polymerase 3 ay kumikilos sa parehong mga humahantong at lagging strands ng tinidor ng pagtitiklop.

Rate ng Synthesis ng DNA

DNA Polymerase 1: Ang DNA polymerase 1 ay maaaring magdagdag ng 10 hanggang 20 nucleotides bawat segundo.

DNA Polymerase 3: Ang DNA polymerase 3 ay maaaring magdagdag ng paligid ng 1000 mga nucleotide bawat segundo.

Konklusyon

Ang DNA polymerase 1 at 3 ay dalawang uri ng DNA polymerases na kasangkot sa pagtitiklop ng prokaryotic DNA. Ang parehong uri ng DNA polymerases ay nagtataglay ng 5 'hanggang 3' na aktibidad ng polimerisasyon. Bilang karagdagan, ang parehong mga enzyme ay nagtataglay ng aktibidad na 3 'hanggang 5' exonuc please para sa pag-proofread. Ang pangunahing pag-andar ng DNA polymerase 3 ay ang pagpapaandar nito sa polimerisasyon. Gayunpaman, ang DNA polymerase 1 ay nagtataglay ng 5 'to 3' exonuc please na aktibidad. Sa pamamagitan ng aktibidad na 5 'to 3' exonuc please, ang DNA polymerase 1 ay may kakayahang alisin ang panimulang aklat. Ang pormang puwang ay pinunan din ng DNA polymerase 1. Samakatuwid, ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng DNA polymerase 1 at 3 ay ang kanilang mga tungkulin sa prokaryotic DNA replication.

Sanggunian:

1. "DNA Polymerase I." Manwal ng Worthington Enzyme. N.p., n.d. Web Magagamit dito. 09 Ago 2017. 2. Marians, Kenneth J., Hiroshi Hiasa, at Deok Ryong Kim. "Tungkulin ng mga Core DNA Polymerase III na Mga Subunit sa Replication Fork α AY ANG LAMANG SUBUNIT NA KINAKAILANGAN PARA SA PROSESIBONG REPLIKASYON." Journal ng Biological Chemistry. N.p., 23 Ene 1998. Web. Magagamit dito. 09 Agosto 2017.

Kagandahang-loob ng Larawan:

1. "PolymeraseDomains" Ni (hindi alam) "Molekul ng Buwan", Marso 2000 - Protein Data Bank (Public Domain) sa pamamagitan ng Wikimedia Wikimedia2. "DNA polymerase III (may mga subunits)" Ni Alepopoli - Sariling gawain (CC BY-SA 3.0) sa pamamagitan ng Commons Wikimedia