Pangunahing Pagkakaiba - Endonuclease vs Exonuclease

Ang mga nuklease ay isang klase ng mga hydrolase na nagkakabit ng mga phosphodiester bond sa pagitan ng mga nucleotide sa mga nucleic acid, kapwa DNA at RNA. Ang mga nuclease ay maaaring nahahati sa dalawang uri batay sa uri ng substrate nucleic acid na pinagtatrabahuhan nila: ribonucleases at deoxyribonucleases. Gumagana ang Ribonucleases sa RNA samantalang ang deoxyribonuclease ay gumagana sa DNA. Ang mga nuklease ay maaari ding nahahati sa dalawa bilang mga endonuclease at exonuclease. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng endonucleases at exonucleases ay iyon ang endonuclease ay inaalis ang strand ng nucleic acid sa gitna samantalang ang exonuclease ay inaalis ang mga hibla ng nucleic acid mula sa mga dulo. Ang pangunahing papel ng mga nuclease sa loob ng cell ay upang makilahok sa mga mekanismo ng pag-aayos ng DNA.

Saklaw ng Mga Susing Lugar

1. Ano ang isang Endonuclease - Kahulugan, Mga Katangian, Pag-andar 2. Ano ang isang Exonuclease - Kahulugan, Mga Katangian, Pag-andar 3. Ano ang Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng Endonuclease at Exonuclease - Balangkas ng Mga Karaniwang Tampok 4. Ano ang Pagkakaiba sa Pagitan ng Endonuclease at Exonuclease - Paghahambing ng Mga Pangunahing Pagkakaiba

Pangunahing Mga Tuntunin: DNA, pagkumpuni ng DNA, Endonuclease, Exonuc please, Restriction Endonucleases, Restriction Site, RNA

Ano ang isang Endonuclease

Ang isang endonuclease ay isang klase ng hydrolase na nakakabit ng mga nucleic acid sa gitna. Ang pagkilos ng endonucleases ay maaaring magresulta sa dalawa o higit pang fragment ng mga nucleic acid. Ang mga endonucleases ay may kakayahang kumilos sa parehong DNA at RNA. Ang cleavage ng ilang endonucleases tulad ng deoxyribonucleases (DNases) ay hindi tiyak. Gayunpaman, maraming mga endonucleases ang nag-cleave ng target na mga pagkakasunud-sunod ng nucleotide sa isang tukoy na pamamaraan. Ang uri ng mga tiyak na endonucleases ay tinatawag paghihigpit endonucleases. May kakayahan silang kilalanin ang isang tukoy na pagkakasunud-sunod ng nucleic acid strand. Sa gayon, ang mga paghihigpit na ito endonucleases ay sumasailalim sa isang lag panahon bago ang kanilang pagkilos sa nucleic acid, pag-scan para sa tukoy na pagkakasunud-sunod ng nucleotide. Ang tukoy na pagkakasunud-sunod ng nucleotide na ito ay tinatawag na site ng paghihigpit.

Larawan 1: Ang aksyon ng Hind III

Ang isang tipikal na site ng paghihigpit ay isang palindromic na pagkakasunud-sunod ng apat hanggang anim na mga nucleotide. Maraming mga paghihigpit na endonucleases ay nagkakabit ng mga hibla ng DNA, na tinawag na solong-maiiwan tayo na mga dulo na tinawag malagkit na dulo. Sa genetic engineering, ang ganitong uri ng restriction endonucleases ay malawakang ginagamit upang makabuo ng recombinant DNA sa pamamagitan ng ligating magkakaibang, nais na mga hibla ng DNA na magkasama. Pinipigilan ng DNA methylation sa mas mataas na mga organismo ang pagkilos ng endonucleases sa kanilang genome. Gayunpaman, ang prokaryotic DNA ay walang methylation. Samakatuwid, ang prokaryotic DNA sa loob ng isang eukaryotic host ay maaaring madaling ma-target para sa cleavage. Ang malagkit na pagbuo ng dulo ng pagkilos ng paghihigpit na endonuclease, ang Hin d III ay ipinapakita sa pigura 1.

Ano ang isang Exonuclease

Ang isang exonuclease ay isang uri ng hydrolases na nakakabit sa chain ng nucleic acid sa dulo nito. Ang mga Exonucleases ay tinatanggal isa-isa ang mga nucleotide mula sa chain ng nucleic acid sa pamamagitan ng hydrolyzing ng mga phosphodiester bond sa alinman sa 3 'o 5' na mga dulo. Tatlong uri ng exonucleases ay maaaring makilala sa parehong mga prokaryote at eukaryotes. Ang mga ito ay 5 'hanggang 3' exonuc please, 3 'hanggang 5' exonuc please, at poly (A) -pesipikadong 3 'hanggang 5' exonucleases. Ang lahat ng tatlong uri ay may papel sa paglilipat ng mRNA. Ang E.coli DNA polymerase III, na nagpapasara sa pagdaragdag ng mga nucleotide sa lumalaking strand sa panahon ng prokaryotic DNA replication, ay binubuo ng 3 'hanggang 5' exonuc please na aktibidad sa ε subunit nito. Inaalis ng ε subunit ang mga mispaired na nucleotide mula sa pagtatapos ng lumalaking kadena.

Larawan 2: 3 'hanggang 5' exonuc please domain ng DNA polymerase I

Ang aktibidad na 3 'hanggang 5' exonuc please ng DNA polymerase III ay tinatawag na aktibidad na pag-proofread ng enzyme. Ang DNA polymerase I ay may parehong 5 'to 3' exonuc please na aktibidad pati na rin ang 3 'hanggang 5' exonuc please na aktibidad. Ang aktibidad na 5 'hanggang 3' exonuc please ay maaaring mag-alis ng hanggang sa sampung mga nucleotide nang paisa-isa. Ang mga Exonuclease ay may mahalagang papel sa pag-proofread ng DNA, pag-aayos ng DNA, at pagpapapanatag ng DNA. Ang 3 'hanggang 5' exonuc please domain ng DNA polymerase I ay ipinakita sa figure 2.

Mga pagkakatulad sa pagitan ng Endonuclease at Exonuclease

Pagkakaiba sa Pagitan ng Endonuclease at Exonuclease

Kahulugan

Endonuclease: Ang Endonuclease ay tumutukoy sa isang enzyme na inaalis ang kadena ng polynucleotide na naghihiwalay sa mga nucleotide maliban sa dalawang dulo.

Exonuclease: Ang Exonuclease ay tumutukoy sa isang enzyme na nakakakuha ng kadena ng polynucleotide mula sa dulo ng kadena sa pamamagitan ng pag-alis ng isa-isang mga nucleotide.

Mekanismo ng Pagkilos

Endonuclease: Ang endonucleases ay nagkakabit ng mga nucleic acid sa gitna ng mga nucleic acid.

Exonuclease: Ang mga exonucleases ay nagkakabit ng mga nucleic acid sa mga dulo.

Lag Phase

Endonuclease: Ang mga paghihigpit ng endonucleases ay sumasailalim sa isang panahon ng pagkahuli bago ang kanilang aktibidad.

Exonuclease: Ang Exonuclease ay walang tagal bago ang kanilang aktibidad.

Mga Resulta

Endonuclease: Ang mga endonucleases ay nagreresulta sa oligonucleotides.

Exonuclease: Ang mga exonucleases ay nagreresulta sa iisang mga nucleotide o nucleoside.

Blunt / Sticky Ends

Endonuclease: Ang endonucleases ay maaaring bumuo ng alinman sa mapurol na mga dulo o malagkit na mga dulo.

Exonuclease: Ang mga Exonucleases ay bumubuo ng mga malagkit na dulo.

Papel

Endonuclease: Pinipigilan ng Endonucleases ang pagpasok ng mga pathogens.

Exonuclease: Ang mga exonucleases ay walang makabuluhang papel sa pagharang sa pagpasok ng mga pathogens.

Mga halimbawa

Endonuclease: Ang DNases, S1 nuclease, at restriction enzymes tulad ng Bam H1, Hin d III, at Eco RI ay ang mga halimbawa ng endonucleases.

Exonuclease: Ang kamandag ng ahas, spleen phosphodiesterase, 3 'hanggang 5' exonuc please domain ng DNA polymerase III, ang aktibidad na 5 'hanggang 3' exonuc please at ang 3 'hanggang 5' exonuc please domain ng DNA polymerase I ay mga halimbawa ng exonucleases.

Konklusyon

Ang endonucleases at exonucleases ay dalawang uri ng mga nuclease, na dumidikit sa mga nucleic acid sa pamamagitan ng hydrolyzing ng mga phosphodiester bond sa pagitan ng mga nucleotide. Ang endonucleases ay nag-cleave ng chain ng polynucleotide sa gitna samantalang ang exonucleases ay nag-cleave ng polynucleotide chain sa mga dulo. Ang restriction endonucleases ay isang uri ng endonucleases, na nakakabit sa kadena ng polynucleotide sa isang tukoy na pagkakasunud-sunod. Mahalaga ang mga exonuclease sa pag-proofread ng replicated DNA. Gayunpaman, ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng endonuclease at exonuclease ay ang lugar ng cleavage ng chain ng polynucleotide.

Sanggunian:

1. McMahon, Mary, at O. Wallace. "Ano ang isang Endonuclease?" WiseGEEK. Conjecture Corporation, 04 Hulyo 2017. Web. Magagamit dito. 08 Ago 2017. 2. "Exonuc please." Wikipedia. Wikimedia Foundation, 01 Agosto 2017. Web. Magagamit dito. 08 Agosto 2017.3. Lodish, Harvey. "Ang Makinarya ng Replika ng DNA." Molecular Cell Biology. Ika-4 na edisyon.U.S. National Library of Medicine, 01 Enero 1970. Web. Magagamit dito. 08 Agosto 2017.

Kagandahang-loob ng Larawan:

1. "Ang site ng Restriksyon ng HindIII at malagkit na mga dulo ng vector" Ni Helixitta - Sariling gawain (CC BY-SA 4.0) sa pamamagitan ng Wikimedia Wikimedia2. "Poly istraktura ko" Ni Christopherrussell - Gunther S, Rother K, Frommel C (CC BY-SA 3.0) sa pamamagitan ng Commons Wikimedia