Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng exome at transcriptome ay ang Ang exome ay ang kumpletong pagkakasunud-sunod ng lahat ng mga exon sa mga gen na may protina-coding sa genome samantalang ang transcriptome ay ang koleksyon ng mga messenger ng RNA molekula na nagmula sa mga gen na naka-coding ng protina. Bukod dito, sumasaklaw ang exome ng 1-2% ng kabuuang pagkakasunud-sunod ng genome habang ang transcriptome ay bumubuo ng mas mababa sa 4% ng kabuuang RNA ng cell.

Ang Exome at transcriptome ay dalawang koleksyon ng mga pagkakasunud-sunod sa mga gen na naka-code sa protina sa genome. Parehong may iba't ibang mga aplikasyon sa pag-aaral ng genomic pati na rin sa diagnosis ng sakit.

Saklaw ng Mga Susing Lugar

1. Ano ang Exome - Kahulugan, Katotohanan, Mga Diskarte 2. Ano ang Transcriptome - Kahulugan, Katotohanan, Mga Diskarte 3. Ano ang Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng Exome at Transcriptome - Balangkas ng Mga Karaniwang Tampok 4. Ano ang Pagkakaiba sa Pagitan ng Exome at Transcriptome - Paghahambing ng Mga Pangunahing Pagkakaiba

Pangunahing Mga Tuntunin

Exon, Exome, mRNA, Protein-Coding Genes, Transcriptome

Ano ang Exome

Ang exome ay ang koleksyon ng mga exons sa mga gen-protein-coding ng genome ng isang partikular na organismo. Ang pagkakasunud-sunod ng pag-coding ng genome ay naipon sa mga gen, na maaaring naka-code para sa mga protina o RNA. Sa prokaryotic genome, ang pagkakasunud-sunod ng pag-coding ay hindi nagambala ng iba pang mga pagkakasunud-sunod habang sa eukaryotic genome, ang pagkakasunud-sunod ng pag-coding ng gene ay nagambala ng mga pagkakasunud-sunod na hindi naka-coding na tinatawag na mga intron. Samakatuwid, ang mga magkakasunod na pagkakasunud-sunod ng pag-coding ay tinatawag na mga exon.

Larawan 1: Mga Exon at Intron

Sa mga gen na naka-coding ng protina, ang RNA polymerase ay naglilipat ng mga intron pati na rin ang mga exon sa pauna na mRNA habang isinasalin. Ang mga isinasamang intron ay aalisin sa mga sumusunod na pagbabago sa post-transcriptional. Ang pangunahing teknolohiya na ginamit sa pag-aaral ng exome ay ang buong-exome sequencing (WES). Ang WES ay kasangkot sa hybridization ng fragmented DNA ng isang partikular na genome upang makilala ang target na mga pagkakasunud-sunod ng DNA na sinusundan ng pagkakasunud-sunod.

Ano ang Transcriptome

Ang Transcriptome ay ang kabuuang hanay ng mga mRNA na ipinahayag sa isang cell. Ang account para sa mas mababa sa 4% ng kabuuang RNA ng cell. Dahil tinukoy ng transcriptome ang komposisyon ng proteome, tinutukoy nito ang kapasidad ng biochemical ng partikular na cell. Gayundin, ang transcriptome ng isang partikular na cell ay hindi maaaring ma-synthesize at palagi itong dumarating sa cell ng anak na babae mula sa parent cell habang naghahati ang cell. Sa gayon, ang salin, na kung saan ay ang proseso ng paggawa ng RNA ay ang hakbang para sa pagpapanatili ng transcriptome.

Larawan 2: Transcriptome ng Pluripotent Cell

Sa kabilang banda, kahit na ang bawat cell ay naglalaman ng impormasyon para sa paggawa ng buong transcriptome ng species, ang nagpapahayag ng mga gen sa cell ay depende rin sa mga kadahilanan sa kapaligiran. Ang dalawang pangunahing teknolohiya na ginamit sa pag-aaral ng transcriptome ay microarray at RNA-seq.

Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng Exome at Transcriptome

Pagkakaiba sa Pagitan ng Exome at Transcriptome

Kahulugan

Ang Exome ay tumutukoy sa bahagi ng genome na binubuo ng mga exon, na impormasyon sa code para sa synthesis ng protina habang ang transcriptome ay tumutukoy sa kabuuan ng lahat ng mga messenger ng RNA na molekula na ipinahayag sa mga gen ng isang organismo. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng exome at transcriptome ay kaya nagpapaliwanag sa sarili mula sa kahulugan na ito.

Kahalagahan

Samakatuwid, ang exome ay ang kabuuang hanay ng mga exon sa mga gen na naka-coding ng protina habang ang transcriptome ay ang kabuuang hanay ng mga mRNA na ipinahayag sa cell.

DNA o RNA

Gayundin, ang exome ay binubuo ng DNA habang ang transcriptome ay binubuo ng RNA.

Halaga

Ang Exome ay kumakatawan sa 1-2% ng kabuuang genome habang ang transcriptome ay kumakatawan sa mas mababa sa 4% ng kabuuang RNA ng cell.

Antas

Ang isa pang pagkakaiba sa pagitan ng exome at transcriptome ay ang exome ay nasa antas ng genomic habang ang transcriptome ay nasa antas ng transcription.

Mga diskarte

Bukod dito, ang pagkakasunud-sunod ng buong exome ay ang pamamaraan upang matukoy ang exome habang ang microarray at RNA-seq ay tumutukoy sa transcriptome.

Konklusyon

Ang exome ay ang buong hanay ng mga exons sa genome na tinutukoy ng WES ng genome. Samakatuwid, ang exome ay isang konsepto na nakabatay sa DNA. Ngunit, ang transcriptome ay isang konsepto na nakabatay sa RNA dahil ito ang buong hanay ng mga mRNA ng cell. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng exome at transcriptome ay ang kanilang konsepto.

Sanggunian:

1. Warr, Amanda et al. "Exome Sequencing: Kasalukuyan at Hinaharap na Mga Pananaw." G3: Mga Gen | Genome | Genetics 5.8 (2015): 1543–1550. PMC. Web 6 Setyembre 2018. Magagamit Dito2. Kayumanggi TA. Mga Genome 2nd edition. Oxford: Wiley-Liss; 2002. Kabanata 3, Transcriptome at Proteome. Magagamit Dito

Kagandahang-loob ng Larawan:

1. "DNA exons introns" Ni National Human Genome Research Institute - (Public Domain) sa pamamagitan ng Commons Wikimedia 2. "The transcriptome of pluripotent cells" Ni Grskovic, M. at Ramalho-Santos, M., The pluripotent transcriptome (Oktubre 10, 2008), StemBook, ed. Ang Pamayanan ng Stem Cell Research, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Larawan 2 Ang transcriptome ng mga pluripotent cells. Grskovic, M. at Ramalho-Santos, M., The pluripotent transcriptome (Oktubre 10, 2008), StemBook, ed. Ang Pamayanan ng Stem Cell Research, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. (CC BY 3.0) sa pamamagitan ng Wikimedia Wikimedia