Pangunahing Pagkakaiba - Genomics vs Proteomics

Ang mga genomics, proteomics, at metabolomics ay mga patlang na kasangkot sa pag-aaral at pag-uuri ng mga nabubuhay na bagay sa pamamagitan ng kanilang mga genome, ang mga produktong protina na na-synthesize batay sa mga tagubilin sa genetiko, at ang uri ng mga molekula na metabolize nila, ayon sa pagkakabanggit. Ang mga genomics at proteomics ay malapit na nauugnay na larangan. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng genomics at proteomics ay iyon Ang genomics ay ang pag-aaral ng buong hanay ng mga genes sa genome ng isang cell habang ang proteomics ay pag-aaral ng buong hanay ng mga protina na ginawa ng cell. Ang Metabolomics, sa kabilang banda, ay ang pag-aaral ng buong hanay ng mga mababang molekular na compound ng timbang na nagsisilbing mga substrate at by-product ng mga reaksiyong enzymatic ng isang cell.

Saklaw ng Mga Susing Lugar

1. Ano ang Genomics - Kahulugan, Mga Diskarte, Pag-uuri 2. Ano ang Proteomics - Kahulugan, Mga Diskarte, Pag-uuri 3. Ano ang Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng Genomics at Proteomics - Balangkas ng Mga Karaniwang Tampok 4. Ano ang Pagkakaiba sa Pagitan ng Genomics at Proteomics - Paghahambing ng Mga Pangunahing Pagkakaiba

Pangunahing Mga Tuntunin: Mga Gen, Genomics, Human Genome Project (HGP), Human Proteome Project (HPP), Proteins, Proteome, Proteomics

Ano ang Genomics

Ang genomics ay tumutukoy sa pag-aaral ng buong hanay ng mga genes sa isang genome. Ang genome ay ang kumpletong hanay ng impormasyong genetiko ng isang organismo, pangunahin na binubuo ng DNA. Ang mga diskarteng mataas na throughput ay ginagamit sa mga genomics upang mapa, pagkakasunud-sunod, at pag-aralan ang mga genome. Ang mga diskarteng kasangkot sa genomics ay nagsasama ng mga diskarte sa pagsunud-sunod ng gen tulad ng direksyon ng pagkakasunud-sunod ng gene, buong pagkakasunud-sunod ng shotgun ng genome, pagtatayo ng mga ipinahayag na mga tag ng pagkakasunud-sunod (EST), pagkilala sa solong mga nucleotide polymorphism (SNPs), at pag-aaral at pagbibigay kahulugan ng sunud-sunod na data na gumagamit ng iba't ibang software at mga database Ang mga pangunahing hakbang ng shotgun sequencing ay ipinapakita sa pigura 1.

Larawan 1: Environmental Shotgun Sequencing (ESS)Sampling, (B) Mga Particle ng Pag-filter, (C) DNA Extraction at Lysis, (D) Cloning at Library, (D) Sequencing, (E) Sequence Assembly

Ang dalawang pangunahing lugar ng genomics ay ang mga struktural genomics at functional genomics. Sa mga genomic ng istruktura, ang istraktura at ang mga kamag-anak na posisyon ng mga gen ay pinag-aaralan habang nasa gumaganang genomics, ang pag-andar o papel ng mga gen sa pag-aayos ng mga aktibidad na metabolic ay pinag-aaralan. Ang Mga Proyekto ng Genome Sequencing ay ang pinakabagong pag-unlad sa genomics. Ang Human Genome Project (HGP) ay nakumpleto noong 2003. Ang mga layunin ng Human Genome Project ay:

Bilang karagdagan sa genome ng tao, ang mga genome ng mouse at bigas ay isinailalim din sa mga genomic na pag-aaral.

Ano ang Proteomics

Ang mga protein ay tumutukoy sa pag-aaral ng buong hanay ng mga protina na ginawa ng isang cell. Ang proteome ay ang kumpletong hanay ng mga protina na ginawa ng cell. Sa proteomics, ang paglalarawan ng istraktura ng 3D at ang pag-andar ng mga protina ay isinasagawa sa pamamagitan ng paggamit ng matataas na pamamaraan ng pag-throughput. Ang mga pamamaraan na kasangkot sa proteomics ay kasama ang pagkuha at electrophoretic na paghihiwalay ng mga protina, pantunaw ng mga protina na may paggamit ng trypsin sa maliliit na mga fragment, pagpapasiya ng pagkakasunud-sunod ng amino acid sa pamamagitan ng mass spectrometry, at pagkilala sa mga protina gamit ang impormasyon sa mga database ng protina. Bukod dito, ang istraktura ng 3D ng protina ay maaaring mahulaan gamit ang mga pamamaraan na batay sa software. Ang pagpapahayag ng mga protina ay maaaring pag-aralan ng mga protein microarray. Ang mga mapa ng protina-network ay maaaring binuo upang matukoy ang mga pakikipag-ugnayan ng protina-protina. Ang iba't ibang mga phenomena ng proteomics ay ipinapakita sa figure 2.

Larawan 2: Mga Proteomic

Ang mga produktong protina ng mga gen ng genome ng tao ay pinag-aaralan sa panahon ng Human Proteome Project (HPP). Ang isa sa mga pangunahing hangarin ng Human Proteome Project ay upang makilala ang mga protina na kasangkot sa mga pangunahing sakit.

Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng Genomics at Proteomics

Pagkakaiba sa Pagitan ng Genomics at Proteomics

Kahulugan

Genomics: Ang genomics ay tumutukoy sa pag-aaral ng buong hanay ng mga genes sa isang genome.

Proteomics: Ang mga protein ay tumutukoy sa pag-aaral ng buong hanay ng mga protina na ginawa ng isang cell.

Phenomena

Genomics: Ang genomics ay nagsasangkot ng pagmamapa, pagkakasunud-sunod, at pagtatasa ng mga genome.

Proteomics: Ang mga protein ay nagsasangkot ng istraktura ng 3D at pag-andar ng mga protina, at mga pakikipag-ugnayan ng protina-protina.

Pag-uuri

Genomics: Ang dalawang uri ng genomics ay ang mga struktural genomics at functional genomics.

Proteomics: Ang tatlong uri ng proteomics ay ang mga istruktural, pagganap, at expression na proteomics.

Mga Mahahalagang Lugar

Genomics: Ang mga proyekto ng pagkakasunud-sunod ng genome tulad ng Human Genome Project ay ang mga mahahalagang lugar ng genomics.

Proteomics: Ang mga pagpapaunlad ng database ng proteksyon tulad ng SWISS-2DPAGE at pagpapaunlad ng software para sa disenyo ng gamot na tinutulungan ng computer ay ang mga mahalagang lugar ng proteomics.

Konklusyon

Ang genomics at proteomics ay dalawang pang-agham na lugar na ginamit sa pag-aaral ng mga organismo. Ang Genomics ay ang pag-aaral ng buong hanay ng mga gen sa isang organismo samantalang ang proteomics ay pag-aaral ng buong hanay ng mga protina na ginawa ng cell. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng genomics at proteomics ay ang pamantayan ng bawat larangan sa panahon ng pag-aaral ng mga organismo.

Sanggunian:

1. Griffiths, Anthony JF. "Genomics: isang pangkalahatang ideya." Isang Panimula sa Pagsusuri sa Genetic. Ika-7 edisyon., U.S. National Library of Medicine, Enero 1, 1970, Magagamit dito. 2. Walang hangganan. "Genomics at Proteomics." Genomics at Proteomics | Walang Hangganan na Biology, Magagamit dito.3. Graves, Paul R., at Timothy A. J. Haystead. "Patnubay sa Molecular Biologist sa Proteomics." Mga Review ng Microbiology at Molecular Biology, American Society for Microbiology, Marso 2002, Magagamit dito.

Kagandahang-loob ng Larawan:

1. "Pagsunud-sunod ng shotgun ng kapaligiran" Ni John C. Wooley, Adam Godzik, Iddo Friedberg - (CC NG 2.5) sa pamamagitan ng Wikimedia Wikimedia2. "Proteomics" Ni Xxl7441 sa English Wikibooks - Inilipat mula sa en.wikibooks sa Commons. (Public Domain) sa pamamagitan ng Commons Wikimedia