Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng gel electrophoresis at SDS PAGE ay iyan ang gel electrophoresis ay isang pamamaraan na ginagamit upang paghiwalayin ang DNA, RNA, at mga protina samantalang ang SDS PAGE ay isang uri ng gel electrophoresis na pangunahing ginagamit upang paghiwalayin ang mga protina. Pangkalahatan, ang SDS PAGE ay nagbibigay ng isang mas mahusay na resolusyon kaysa sa regular na gel electrophoresis.

Ang Gel Electrophoresis at SDS PAGE ay mga diskarte sa biotechnology na makakatulong sa paghihiwalay ng macromolecules batay sa singil at laki. Kadalasan, ang gel electrophoresis ay gumagamit ng agarose gel stabs para sa paghihiwalay habang ang SDS PAGE ay gumagamit ng polyacrylamide gel stabs.

Saklaw ng Mga Susing Lugar

1. Ano ang Gel Electrophoresis - Kahulugan, Pamamaraan, Kahalagahan 2. Ano ang SDS PAGE - Kahulugan, Pamamaraan, Kahalagahan 3. Ano ang Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng Gel Electrophoresis at SDS PAGE - Balangkas ng Mga Karaniwang Tampok 4. Ano ang Pagkakaiba sa Pagitan ng Gel Electrophoresis at SDS PAGE - Paghahambing ng Mga Pangunahing Pagkakaiba

Pangunahing Mga Tuntunin: Agarose, DNA, Gel Electrophoresis, Polyacrylamide, Proteins, SDS PAGE

Ano ang Gel Electrophoresis

Ang gel electrophoresis ay isang pamamaraan na naghihiwalay sa mga fragment ng macromolecules tulad ng DNA, RNA, at mga protina batay sa kanilang laki at singil. Sa panahon ng gel electrophoresis, ang macromolecules ay lumilipat sa ilalim ng impluwensya ng isang electric field sa isang gel matrix, na naglalaman ng mga pores kung saan gumagalaw ang macromolecules. Ang gel electrophoresis ay ang pangkalahatang pamamaraan na sumusuri sa DNA mula sa PCR, RFLP, cloning, DNA sequencing o blotting diskarte. Ang mga nanoparticle ay maaari ring paghiwalayin ng gel electrophoresis. Ang gel stab ay inihanda mula sa isang polysaccharide na tinatawag na agarose na nagmula sa damong-dagat. Ang mga agarose gels ay binubuo ng mga long-chain agarose Molekyul na magkakaugnay bilang isang spider web. Inilalarawan ng video 1 ang paghahanda ng isang agarose gel.

Ang parehong DNA at RNA ay naglalaman ng mga pangkat ng pospeyt sa bawat isa sa kanilang monomer nucleotide. Samakatuwid, nagtataglay sila ng pantay na negatibong singil sa buong Molekyul. Bukod dito, lumipat sila patungo sa positibong elektrod sa ilalim ng electric field. Ang bilis ng paglipat ay nakasalalay sa laki ng nucleic acid. Ang mga mas maiikling molekula ay mabilis na lumipat sa mga pores habang ang mas malalaki ay tumatagal ng ilang oras.

Larawan 1: Mga Banda ng DNA sa isang Agarose Gel

Ano ang SDS PAGE

Ang SDS PAGE (sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis) ay isang pamamaraang pansuri na ginagamit upang paghiwalayin ang mga sinisingil na mga molekula batay sa laki. Sa prosesong ito, ang SDS ay ginagamit upang ihiwalay ang mga protina sa pamamagitan ng denaturing ang mga ito. Tulad ng SDS ay isang detergent; ang tertiary na istraktura ng mga protina ay nagagambala nito, na nagdadala ng nakatiklop na protina sa isang linear na molekula. Gayundin, pinahiran nito ang linear protein Molekyul na may isang pare-parehong negatibong singil. Ang SDS PAGE ay binubuo ng dalawang gels na may iba't ibang konsentrasyon. Ang tuktok na layer ay tinatawag na stacking gel kung saan na-load ang mga sample habang ang ilalim na layer ay tinatawag na resolving gel. Ang konsentrasyon ng polyacrylamide ng stacking gel ay 3.5-4% (malaking laki ng butas ng pore) at pinapaloob nito ang mga protina sa isang banda. Ang konsentrasyon ng polyacrylamide sa paglutas ng gel ay 4-20% (maliit na laki ng pore) at pinaghihiwalay nito ang mga protina batay sa kanilang laki. Ipinapakita ng video 2 ang paghahanda ng isang SDS PAGE.

Ang SDS PAGE ay nagbibigay ng isang mabilis na paghihiwalay ng mga protina, tumutulong sa kasunod na pagtatasa tulad ng Western blotting.

Larawan 2: Mga Protein Band sa SDS PAGE

Dahil ang lakas ng paglutas ng SDS PAGE ay mas mataas kaysa sa isang regular na agarose gel, tumutulong ang SDS PAGE na paghiwalayin ang maliliit na mga fragment ng DNA na may 5-500 bp na laki.

Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng Gel Electrophoresis at SDS PAGE

Pagkakaiba sa Pagitan ng Gel Electrophoresis at SDS PAGE

Kahulugan

Gel electrophoresis: Ginamit ang pamamaraan upang paghiwalayin ang mga fragment ng macromolecules tulad ng DNA, RNA, at mga protina batay sa kanilang laki at singil

SDS PAGE: Isang pamamaraang analohikal na ginamit upang paghiwalayin ang mga sisingilin na mga molekula batay sa laki

Komposisyon

Gel electrophoresis: Pantay sa buong buong gel; binubuo ng agarose

SDS PAGE: Dalawang gels na may magkakaibang konsentrasyon; binubuo ng polyacrylamide

Patakbuhin ang Configuration

Gel electrophoresis: Pahalang na pagtakbo

SDS PAGE: Patayo na patakbo

Pamamaraan ng Casting

Gel electrophoresis: Itinakda habang lumalamig ito

SDS PAGE: Itinakda ng isang reaksyon ng kemikal

Sinlaki ng butas ng balat

Gel electrophoresis: Ang laki ng pore ay hindi pare-pareho; mas mataas ang konsentrasyon ng agarose, mas maliit ang laki ng pore

SDS PAGE: Ang laki ng pore ay pare-pareho; ang ratio ng acrylamide sa bis-acrylamide ay tumutukoy sa laki ng pore

Konsentrasyon

Gel electrophoresis: 0.5-2%

SDS PAGE: 6-15%

Paghihiwalay

Gel electrophoresis: 50-20, 000 bp mga nucleic acid

SDS PAGE: 5-250, 000 Da protina

Mga Kundisyon

Gel electrophoresis: Pangkalahatang tumatakbo sa ilalim ng mga katutubong kondisyon

SDS PAGE: Mga kondisyon sa denaturing

Paghahanda

Gel electrophoresis: Simple

SDS PAGE: Isang komplikadong proseso

Paglamlam

Gel electrophoresis: Na may ethidium bromide

SDS PAGE: Paglamlam ng Coomassie o paglamlam ng pilak

Konklusyon

Ang gel electrophoresis ay isang pamamaraang mapanuri na naghihiwalay sa macromolecules tulad ng DNA, RNA, at mga protina batay sa kanilang laki. Ang SDS PAGE ay isang uri ng gel electrophoresis na pangunahing ginagamit upang paghiwalayin ang mga protina sa ilalim ng mga kondisyong denaturing. Ang SDS PAGE ay may mas mataas na kapangyarihan sa paglutas kung ihahambing sa regular na gel electrophoresis. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng gel electrophoresis at SDS PAGE ay ang uri ng macromolecules na pinaghiwalay at ang kanilang pamamaraan.

Sanggunian:

1. "Gel Electrophoresis." Khan Academy, Magagamit Dito2. "SDS Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE)." Diamantina Institute, 26 Abril 2017, Magagamit Dito

Kagandahang-loob ng Larawan:

1. "Gel electrophoresis 2" Von Mnolf - Kunan ng larawan sa Innsbruck, Austria (CC BY-SA 3.0) sa pamamagitan ng Commons Wikimedia 2. "Coomassie3" Ni Yikrazuul - Sariling gawain (CC BY-SA 3.0) sa pamamagitan ng Wikimedia Wikimedia