Pangunahing Pagkakaiba - miRNA vs siRNA

Ang miRNA at siRNA ay dalawang uri ng non-coding RNA na kasangkot sa regulasyon ng gene. Nagsisilbi din sila bilang isang nobela na klase ng mga therapeutic agent sa paggamot ng mga cancer at impeksyon. Parehong miRNA at siRNA ay maikli, duplex RNA na mga molekula, na nagsasagawa ng mga epekto ng pagpapatahimik ng gen sa pamamagitan ng pag-target sa messenger RNA (mRNA) sa antas ng posttranscriptional. Kahit na ang kanilang pag-andar ay pareho sa pagpatahimik ng gene, ang mga mekanismo ng aksyon at mga klinikal na aplikasyon ay magkakaiba sa bawat isa. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng miRNA at siRNA ay iyan ang miRNA ay maaaring kumilos sa maraming mga target sa mRNA, ngunit ang siRNA ay kumikilos lamang sa isang solong target na mRNA, na napaka-tukoy sa uri ng siRNA. Kaya, ang mga therapeutic na diskarte ng miRNA at siRNA ay magkakaiba rin sa bawat isa.

Saklaw ng Mga Susing Lugar

1. Ano ang miRNA - Kahulugan, Mga Tampok, Pag-andar 2. Ano ang siRNA - Kahulugan, Mga Tampok, Pag-andar 3. Ano ang Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng miRNA at siRNA - Balangkas ng Mga Karaniwang Tampok 4. Ano ang Pagkakaiba sa Pagitan ng miRNA at siRNA - Paghahambing ng Mga Pangunahing Pagkakaiba

Pangunahing Mga Tuntunin: AGO2, Dicer, Gene Silencing, MicroRNA (miRNA), pri-miRNA, RISC, RNA Interference (RNAi), Small Interfering RNA (siRNA)

Ano ang miRNA

Ang microRNA Ang (miRNA) ay isang maikli, solong-strands na RNA Molekyul, na binubuo ng 19-25 nucleotides. Ang unang miRNA ay natuklasan sa C. Elegans noong 1993. ang miRNA ay isang klase ng maliit na nakakagambalang RNA, na pumipigil sa ekspresyon ng gene sa antas ng post-transcriptional. Ang transcription ng miRNA genes ay ginagawa ng RNA polymerase upang, makabuo ng pangunahing miRNA (pri-miRNA). Ang pri-miRNA ay 5 'capped, polyadenylated sa 3' dulo nito, at bumubuo ito ng isang dobleng-straced na istraktura ng stem loop. Ang mga molekulang pri-miRNA na ito ay na-cleaved ng isang microprocessor complex, na bumubuo sa precursor miRNA (pre-miRNA). Ang mga duplex molecule ng pre-miRNA ay binubuo ng 70-100 nucleotides. I-export ang 5 protina na nagdadala ng mga pre-miRNA Molekyul sa cytoplasm mula sa nucleus para sa karagdagang pagproseso sa miRNA ng mga protina ng Dicer. Samakatuwid, ang miRNA ay isang RNA duplex, na binubuo ng 18-25 nucleotides. Ang mga protein ng Dicer ay isang dalubhasang uri ng tulad ng RNase III-tulad na enzyme.

Larawan 1: Ang pagbuo at pag-andar ng miRNA

Ang pagkakaugnay ng miRNA na may protina na silencing complex (RISC) na RNA ay bumubuo ng isang komplikadong tinatawag na miRISC. Ang sense strand ng miRNA ay inilabas sa miRISC complex. Pagkatapos, ang mga mRNA na may pantulong na pagkakasunud-sunod sa antisense RNA strand sa miRISC complex ay napili ng bahagyang komplementaryong pagpapares sa base. Ang pagbubuklod ng miRISC complex na may target na mRNA ay maaaring mapigilan ang pagsasalin, i-degrade ang mRNA Molekyul o i-cleave ang mRNA Molekyul.

Ano ang siRNA

Ang maliit na nakakagambalang RNA Ang (siRNA) ay isa pang uri ng maikli, duplex RNA, na pinatahimik ang ekspresyon ng gene sa pamamagitan ng pag-cleave ng mRNA. Ang siRNA ay unang natuklasan din sa C. Elegans sa isang proseso na tinawag na RNA interferensi (RNAi) ng mabisang pagsugpo ng gene ng exogenous RNA. Ang mga double-straced RNA (dsRNA) na mga molekula ay maaaring mabuo sa loob ng selyula sa pamamagitan ng paglilipat ng mga cellular genes, nakakaapekto sa mga pathogens o artipisyal na pagpapakilala. Ang dsRNA na ito ay na-cleaved ng mga protein ng Dicer sa maliliit na dsRNA na kilala bilang siRNA. Ang mga siRNA na ito ay 21-23 nucleotides ang haba na may dalawang mga nucleotide na overhang sa 3’na dulo. Ang siRNA sa cytoplasm ay nauugnay sa mga protina ng RISC at ang sense strand ng siRNA Molekyul ay naitala ng isang endonuclease na tinatawag na argonaute 2 (AGO2) na bahagi ng RISC. Ang nauugnay na mRNA Molekyul ay kinikilala ng antisense RNA strand ng siRNA, na nakakabit pa rin sa RISC protein. Ang cleavage ng target na mRNA Molekyul ay ginagawa ng sangkap na AGO2.

Larawan 2: Gene na pinatahimik ng siRNA

Dahil ang siRNA ay maaari lamang mag-target ng isang tukoy na mRNA Molekyul, ang isang tukoy na pagpapatahimik ng ekspresyon ng gene ay maaaring makamit ng siRNA. Bukod dito, dahil ang siRNA ay likas na wala sa mga mammal, maaari itong magamit bilang isang tukoy na therapeutic agent.

Mga pagkakatulad sa pagitan ng miRNA at siRNA

Pagkakaiba sa pagitan ng miRNA at siRNA

Kahulugan

miRNA: Ang miRNA ay isang maikling segment ng RNA na pinipigilan ang ekspresyon ng gene sa pamamagitan ng pagbubuklod sa mga pantulong na segment ng messenger na RNA.

siRNA: Ang siRNA ay isang maikling segment ng RNA na nagpapatakbo sa RNA interferensi (RNAi) pathway.

Pangyayari

miRNA: Ang miRNA ay matatagpuan sa mga hayop at halaman.

siRNA: Ang siRNA ay matatagpuan sa mas mababang mga hayop at halaman, ngunit hindi sa mga mammal.

Istraktura

miRNA: Ang miRNA ay isang 18-25 nucleotides na haba ng solong-straced na molekula na may dalawang mga nucleotide na overhung sa 3 'na dulo.

siRNA: ang siRNA ay isang 21-23 nucleotides na haba ng duplex Molekyul na may dalawang mga nucleotide na overhang sa 3’na dulo.

Bago ang Pagproseso ng Dicer

miRNA: Bago ang pagpoproseso ng dicer, ang miRNA ay nasa pauna na form na miRNA, na naglalaman ng 70-100 na mga nucleotide na may kalat na hindi pagtutugma. Ang pre-miRNA ay umiiral sa isang istraktura ng hairpin loop.

siRNA: Bago ang pagpoproseso ng dicer, ang siRNA ay isang dobleng-straced na molekula ng RNA, na naglalaman ng 30-100 na mga nucleotide.

Pagkumpleto

miRNA: Ang miRNA ay bahagyang komplementaryo sa mRNA. Pangunahin nitong target ang hindi naisalin na mga rehiyon ng miRNA.

siRNA: Ang siRNA ay ganap na pantulong sa target na mRNA.

Bilang ng Mga Target ng mRNA

miRNA: Ang miRNA ay may kakayahang mag-target ng higit sa 100 mga uri ng mRNA nang sabay-sabay.

siRNA: Ang siRNA ay may kakayahang mag-target lamang ng isang uri ng mRNA.

Mekanismo ng Regulasyon ng Gene

miRNA: Pinipigilan ng miRNA ang pagsasalin sa pamamagitan ng pagkasira ng mRNA. Ang endonucleolytic cleavage ay bihirang nangyayari sa miRNA kapag ang isang mataas na rate ng pagkakumpleto ay matatagpuan sa target.

siRNA: Kinokontrol ng siRNA ang expression ng gene sa pamamagitan ng endonucleolytic cleavage.

Regulasyon

miRNA: Kinokontrol ng miRNA ang magkaparehong mga gen na kung saan inilipat ang miRNA pati na rin maraming iba pang mga gen.

siRNA: Kinokontrol lamang ng siRNA ang mga genes kung saan kinopya ang siRNA.

Mga Klinikal na Aplikasyon

miRNA: Nagsisilbi ang miRNA bilang target ng gamot, therapeutic agent o tool na diagnostic at biomarker.

siRNA: Ang siRNA ay nagsisilbing isang therapeutic agent.

Konklusyon

Ang miRNA at siRNA ay ang dalawang uri ng non-coding RNA, na kasangkot sa regulasyon ng pagpapahayag ng gene. Parehong miRNA at siRNA ay doble-straced RNA moleules. Ang parehong uri ng RNA ay sumasailalim sa magkatulad na mekanismo ng pagpatahimik ng gen sa pamamagitan ng isang proseso na kilala bilang pagkagambala ng RNA. Gayunpaman, ang miRNA ay may kakayahang mag-target ng maraming uri ng RNA dahil ang pagkakasunud-sunod ng miRNA ay komplementaryo sa hindi naisalin na mga rehiyon ng isang mRNA. Sa kabilang banda, ang siRNA ay may kakayahang mag-target lamang ng isang napiling uri ng mRNA. Samakatuwid, ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng miRNA at siRNA ay ang pagiging tiyak ng bawat uri ng RNA sa pagkagambala ng RNA.

Sanggunian:

1. "Panimula ng MiRNA (microRNA)." Sigma-Aldrich. N.p., n.d. Web Magagamit dito. 24 Hulyo 2017. 2. "Mga Application ng SiRNA." Mga Aplikasyon - siRNA | GE Dharmacon. N.p., n.d. Web Magagamit dito. 24 Hulyo 2017. 3. "SiRNA Versus miRNA bilang Therapeutics para sa Gene Silencing." Direksyon sa Agham. N.p., n.d. Web Magagamit dito. 24 Hulyo 2017.

Kagandahang-loob ng Larawan:

1. "MiRNA" Ni Kelvinsong - Sariling gawain (CC BY 3.0) sa pamamagitan ng Wikimedia Wikimedia 2. "Mekanismo ng SiRNA.2" Ni Singh135 - Sariling gawain (CC BY-SA 4.0) sa pamamagitan ng Commons Wikimedia